星泉（药师丸博子 饰）是一名普通的高中女生，母亲早年去世，父亲亦在最近因车祸离开人间，她孤零零地与父亲的情人麻由美（风祭雪 饰）生活在一起。星泉的远房亲戚是黑帮目高组的组长，如今只剩下四个人的目高组成

怪奇现象调查组织SSP成员某天收到了来自艾克斯奥特曼的变身器艾克斯终端。有雨落入了敌人的陷阱，特殊防卫队Xio的队员大空大地（高桥健介 饰）被迫与艾克斯奥特曼解除了一体化的联系。在此之后，大地下落不明